|
تراريخت يا ترنس ژنيک چيست؟ در ادامه مطلب با فرايند تراريخت يا ترنس ژنيک آشنا خواهيم شد. فرايندي که تا چند سال قبل فقط در فيلمهاي تخيلي آنرا شاهد بوديم اما امروزه اين تخيلات به واقعيت پيوسته است.... |
 |
|
| |
آنچه که از طرف انجمن علمی - دانشجویی بیوتکنولوژی دانشگاه الزهرا در نخستین نمایشگاه دستاوردهای بیوتکنولوژی عرضه شد:
دسته بندی بیوتکنولوژی بوسیلۀ رنگها
بروشور معرفی مهمترین وبسایتهای بیوتکنولوژی
محققان موفق به كشف روشي سريع براي شناسايي زيستنشانههاي بيماري آلزايمر شدهاند. اين روش كه بر مبناي تحليل طيفهاي پراش دو- فوتون نانوذرات طلا است به طور گزينشپذيري پروتئيني كه در بدن يك بيمار مبتلا به آلزايمر موجود است، را شناسايي ميكند و نسبت به روشهاي قبل 100 برابر گزينشپذيرتر است. اين روش به تشخيص زودهنگام اين بيماري كمك شاياني ميكند. آلزايمر با نابودكردن سلولهاي مغز باعث ايجاد مشكلاتي در حافظهي طولانيمدت ميشود. متاسفانه درماني براي آلزايمر وجود نداشته و تنها در مراحل پيشرفته بيماري و با شناسايي پلاكهاي خوني كهنه و تارهاي عصبي درهمتنيدهي موجود در بافت مغز، قابل تشخيص است. اين تارهاي عصبي درهمتنيده متشكل از پروتئين تو ("Tau") در سلولهاي مغز هستند. |
 |
| مراحل مختلف شناسايي زيستنشانههاي بيماري آلزايمر توسط نانوذرات طلا. |
| دانشمندان متوجه شدهاند كه پروتئينهاي تو كه سازندهي نرونها هستند با وجود بيماري آلزايمر تغيير ساختار فاحشي نشان ميدهند و بشدت فسفاته هستند. اندازهگيري اين پروتئينها ميتواند روشي براي تشخيص بيماري در مراحل اوليه آن باشد تا با مصرف بموقع دارو از شدت پيشرفت بيماري كاسته شود. اين روش كه توسط محققان دانشگاه ايالتي جكسون ارائه شدهاست بر مبناي متصلكردن نوعي پادتن به نانوذرات طلاست كه قادر به شناسايي اين پروتئينهاي تغيير ساختار يافته در بيماران آلزايمر است. با حضور اين پروتئينهاي خاص دستههاي بهم پيوستهاي از اين نانوذرات در محل حضور پروتئين ها شكل ميگيرند (شكل را ببينيد). در شكل اين دستهها با رنگ آبي نشان داده شدهاند كه با نانوذرات مستقل كه به رنگ قرمز هستند، متمايزند. اين تغيير رنگ با تحليل طيف بدست آمده از پراش نور دو- فوتون از محلول قابل تشخيص است. در اين روش با تحريك نانوذرات با نوري با طول موج مشخص، دو- فوتون پراش ميشوند. نتايج اين تحقيق در مجلهي ACS Nanoمنتشر شدهاست. |
واكنش زنجيرههاي پليمراز (PCR) روشي است براي تكثير اختصاصي قطعات DNA كه نخستين بار در سال 1985 گزارش شد. در اين روش قطعهاي از DNA به طور انتخابي با بهكارگيري دو پرايمر اوليگونوكلوئوتيدي و آنزيم پليمراز Tag ميتوان تا ده هزار برابر تكثير كرد. هريك از اين دو پرايمر به رشتههاي مخالفشان در روي DNA هدف متصل شده و مكان آنها بهگونهاي است كه سنتز زنجيره DNA توسط آنزيم پليمراز تنها در ميان دو پرايمر انجام ميگيرد.
از آنجا كه زنجيرههاي تازه ساخته شده خود مكمل پرايمرها است، اين چرخه ميتواند پس از يك مرحله واسرشته شدن زنجيرههاي DNA از هم تكرار شود. به عبارتي PCR روشي است براي يك برنامه دورهاي مشتمل براي تكرار گرم و سرد كردن و DNA بهكمك يك آنزيم DNA پليمراز مقاوم به گرما و يك جفت پرايمر تحت تكثير انتخابي قرار ميگيرد و از طريق اين روش DNA به صورت تصاعد هندسي زياد ميشود. امروزه روش PCR جايگاه بسيار مهمي را در جنبههاي مختلف مهندسي ژنتيك، بيولوژي مولكولي، ميكروبشناسي تشخيصي تشخيص سرطان و بيماريهاي ژنتيك، تشخيص هويت، جرم شناسي (پزشكي قانوني جهت تشخيص منشأ نمونه اسپرم، خون و ...) تعيين ترادف، باستانشناسي، مطالعات تكاملي موجودات و ... پيدا كرده است. كاربرد بيشتر و دقيقتر تكنيك PCR در تشخيص، روشهاي تغيير يافتهاي از آن به وجود آمده است كه به تعدادي از آنها اشاره ميشود.
مالتيپلكس پي سي آر (Multiplex-PCR)
يكي از روشهاي تغييريافته PCR است كه در آن تنها يك جايگاه ژني مورد بررسي قرار ميگيرد، با استفاده از پرايمرهاي مختلف ميتوان چندين جايگاه را مورد بررسي قرار داد و از چندين جفت پرايمر اختصاصي جهت تكثير استفاده ميشود. كاربردهاي اين روش ميتواند شامل موارد زير باشد:
1) بخشهاي بزرگي از يك DNA (هدف)، جهت جستوجوي تغييرات ميتواند بررسي شود. براي مثال كشف نقصها در بيماري ديستروفي عضلاني روشن يا كشف بخشهاي مختلف IS6110 و IS986 در مايكروباكتريوم توبر كلوزيس عامل بيماري سل،
2) بخشهاي غيرمربوط به هم در ژنوم هدف ميتواند مورد آزمايش واقع شود و
3) ميتوان از طريق اين روش با پرايمرهاي مختلف به جستوجوي عوامل مختلف پرداخت، مانند شناسايي عوامل شايع مننژيت. اين روش بيشتر براي شناسايي جايگاههايي از ژنها به كار ميرود كه انواع زيادي از جهش در آنها به وقوع ميپيوندد.
آرتي-پيسي آر (RT-PCR)
اين روش به PCR نسخهبرداري معكوس نيز معروف است كه ماده اوليه در آن RNA است. اولين مرحله در اين روش تبديل RNA به DNA (DNAاي كه مكمل توايسهاي mRNA است) توسط آنزيم نسخهبردار معكوس صورت ميگيرد (RT). برخي از موجودات مانند برخي از ويروسهاي RNAدار، ژنومشان تنها از RNA ساخته شده است. بعضي از ويروسها مانند ويروس هپاتيت B هرگز به شكل DNA مابين در اثر آنزيم نسخهبردار معكوس درنميآيد. آنزيم نسخهبردار معكوس (RT) در اين روش از "Avian Myeloblastosis Virus (AMV)" و "Moloney Murine Leu Kemia Virus (MMLV) " بهدست آمد.
كاربرد اين آنزيم بهدليل آنكه آنزيم به حرارت حساس بود در ابتدا پايين بود ولي با كشف باكتري به نام "ترموس ترموفيلوس" يك DNA پليمر از مقاوم به نام (Tth) بهبود يافت كه در حضور يون Mn+2 داراي فعاليت نسخهبرداري معكوس است و در دماي 72 درجه سانتيگراد توسط اين آنزيم از روي RNA، DNA ساخته ميشود و سپس Mn+2 اضافي توسط اتيلن گليكول تترااستيك اسدي (EGTA) حذف ميشود و سپس اين آنزيم از DNAاي كه خود ساخته استفاده و آن را تكثير ميكند.
آرمز پيسيآر (ARMS-PCR)
اين روش تكثيري قدرتمند براي مشخص كردن جهشهاي نقطهاي است. در اين روش از پرايمرهاي جهش يافته و طبيعي در دو لوله جداگانه استفاده ميشود. اگر عمل پليمريزاسيون در لوله حاوي پرايمر طبيعي انجام شود، نشاندهنده نبود جهش نقطهاي در باز مورد نظر است و اگر عمل پليمريزاسيون در لوله حاوي پرايمر جهش يافته انجام شود، نشاندهنده حضور جهش نقطهاي در باز مورد نظر است. اين روش نامهاي ديگري نيز دارد از جمله MAMA-PCR مخفف Amplificatin Multation Assay Mismatch و COP-PCR مخفف Competitive Oligonucleotide Primming.
نستد پيسيآر (Nested-PCR)
در اين روش از دو جفت پرايمر استفاده ميشود، طوري كه جفت دوم در بني جفت اول جاي ميگيرد. در اين روش ابتدا پرايمر بيروني توالي هدف در طول 30-15 چرخه تكثير ميشود، سپس محصول PCR حاصل به لولهاي ديگر منتقل ميشود و بهعنوان الگو و با استفاده از جفت پرايمر داخلي مرحله دوم PCR انجام شده و ترادف كوچكتري از DNA كه درون PCR اولي است، به اندازه 40-15 چرخه تكثير ميشود.
مزاياي اين روش تغيير يافته PCR عبارت است از: 1) نياز به پروب (كاوشگر) و تأييدهاي بعدي كمتر است، 2) حساسيت در اين روش به ميزان زيادي بالاتر است و 3) به دليل انتقال محصول PCR دور اول به لوله جديد، ممانعت كنندهها رقيق ميشود. اين روش در تعيين جنسيت جنين در سه ماهه اول بارداري استفاده شده و از اين طريق توانستهاند بيماريهاي وابسته به جنس را تعيين كرده و از تولد كودكان بيمار جلوگيري كنند.
همچنين ويروس "سيتومگالوويدوس" كه ميتواند سبب ناشنوايي در 1% از كودكان شود، توسط اين روش تشخيص داده شده و امكان درمان زودهنگام از اين طريق امكانپذير است. جنينهاي مبتلا به سندروم داون نيز در مرحله بارداري مادر با اين روش تشخيص داده شدند.
Real-Time PCR
به علت ورود نسل جديدي از ترموسايكلرها با سيستم فلورومتري كه اجازه پايش پيوسته خاصيت فلوئورسانس محصول PCR در زمان جمع شدن را ميدهد، اين روش ابداع شد. در اين روش از كاوشگرها يا پروبهاي هيبريداسيون نشاندار شده با رنگهاي فلورسانس در انتهاي 5 يا 3 استفاده ميشود. كه امكان پايش پيوسته محصول PCR را بدون جداسازي آنها در روشهاي الكتروفورز در ژل آگاروز يا ژل پلي آكريل آميد ميدهد. اين سيستم در سال 1992 كشف شد. اين روش به دليل كاهش زمان سيلكهاي PCR، حذف مرحله Post-PCR و كاربرد نشانگرهاي فلوروژنيك و روشهاي حساس آشكارسازي تابش آنها باعث افزايش سرعت اين سيستم نسبت به سيستم PCR معمولي شده است. سازندگان و كاربران اين روش سعي ميكنند محصول PCR كوچكتر طراحي كنند تا سرعت افزايش يابد اما تجربه نشان داده كه كاهش اندازه محصول لزوماً بازده PCR را بهينه نميكند. البته اين روش داراي معايبي نيز است از جمله ميتوان به عدم ناتواني در مشخص كردن اندازه محصول بدون باز كردن سيستم و ناسازگار بودن برخي پلت فرمها با شيمي برخي رنگهاي فلورژنيك اشاره كرد. براي شناسايي بسياري از ويروسهاي عامل بيماريهاي انسان از اين روش استفاده شده است.
دکتر گلناز رفیعی
مراجع:
1. Guven.S,Yilmaz. E,kutby.H and eta. The Diagnostic Value of Polymerase chain Reaction (PCR) in Bronchialveolveolar Lavage. Eastern Journal of Medicine 9(1): 07-12, 2004
2. Maeda.S and etal. Helicobacter Pylori specific nested PCR assay for the detection of 23 S rRNA mutation associated with clarithomycin resistance. Gut.bmj.com.2007
3. Pusterla.N and etal. Real time polymerase chain Teaction: A Novel Molecular Diagnostic Tool for equine Infectious Disease. Journal vet International Medical; 20:3-12, 2006.
4. Salto-Telez M,etal. Multiplex RT-PCR for the Detection of Leukemia-Associated Translations. Journal of Molecular Diagnostic; 54):231-236, 2003.
5. Vakulenko.S.B and etal. Multiplex PCR for Detection of Aminoglycoside Redsistance Gene in Enterococci. Animicrobal agents and chemotherapy; 47(4)1423, 2003.
6. Hajbeigi.H and Radpour.R. Gentic Terminology Book. First edition. 424 Page 2002
بسم الله الرحمن الرحیم
با عنایات خاصه حضرت بقیه الله الاعظم -روحی فداه-ترجمه کتاب ژن ۱۰ که ترجمه اینجانب می باشد بصورت قسمت به قسمت برای کاربران قرار داده خواهد شد.
پس بزودی ...
محيط دريا زيستگاه انواع زيادي از جانوران و گياهاني است كه بهعنوان بخشي از سوخت و ساز خود، تركيبات فعال بيولوژيكي توليد ميكنند كه براي انسان بسيار سودمندند. از ابتداي دهه 1970 پيشرفتهاي بسياري در كشف دارو از جانداران دريايي حاصل شده است. هر چند هنوز كمتر از 1 درصد جانداران دريايي مورد بررسي قرار گرفتهاند، ولي نشان داده شده است كه تركيبات توليد شده به وسيله بعضي از جانداران دريايي (مانند جلبكها، اسفنجها و مرجانها) خواص آنتيبيوتيكي، ضد ويروسي و ضد التهابي دارند. اين مواد براي درمان بيماريهاي مختلف از جمله سرطان، بيماريهاي التهابي مانند آرتروز و آسم در مرحله آزمايشهاي باليني هستند. به احتمال زياد، بر اثر پيشرفت روشهاي تشخيصي، مواد ديگري كه داراي خواص ضد انگلي، محرك رشد، بالا برنده سيستم ايمني و ترميمكننده جراحات باشند نيز شناسايي خواهند شد. انتقال ژنهاي دلخواه از ماهيها به ميكروارگانيسمهاي غيردريايي مانند اشريشيكاكلي، براي توليد فرآورده از طريق تخمير ممكن است روش موثرتري براي توليد مواد دارويي باشد؛ بي آنكه به منابع طبيعي دريا نيز آسيبي وارد شود.
در پژوهشهاي مرتبط ديگر، يكسري از گياهان دريايي و مواد استخراج شده از آنها، خواص ضد قارچي، ضد باكتريايي، ضد ويروسي، ضد كرمهاي رودهاي و ضد آرترواسكلروتيك (Arthrosclerotic) از خود نشان دادهاند.
چکیده:
در این مطلب سعی می شود معرفی گیاه جو، تیپ های زراعی و وحشی جو ، سرچشمه شروع کارهای اصلاحی بر روی گیاه جو ، موفقیت های اصلاحی بعمل آمده و اساس و پایه ی این موفقیت ها ، چگونگی تلاقی ها بر روی گیاه جو ، روشهای گزینش متداول و غیر متداول همچنین روشهای اصلاحی ساده که دارای 4 روش می باشد و اهداف استرا تژیکی آن(جو) را بررسی کنیم.
مقدمه:
جو (Hordeum vulgar)
یکی از غلات مهم جهان است که به عنوان غذا مورد استفاده بشر و حیوانات قرار می گیرید این گیاه علفی متعلق به خانوادۀ گندمیان می باشد و دارای انواع زراعی و وحشی می باشد و خاستگاه واقعی جو هنوز ناشناخته است .
اما بسیاری از محققین برجسته خاستگاه این گیاه را کوه های زاگرس در غرب ایران آناتولی جنوبی و فلسطین می دانند . پر پایه ی نظریه ی والیوف مبدا جو ریشک دار و غلاف دار کشور اتیوپی و شمال آفریقا و مبدا بدون ریشک ریشک کوتاه و کلاهک دار آسیای جنوب شرقی بویژه چین ژاپن تبت است .
قدیمی ترین تقسیم بندی Hordeum به زمان لینه یعنی سال 1753 بر می گردد که در Species olantarum صورت پذیرفت و این جنس به هشت گونه تقسیم شد .
به گزارش خبرنگار پژوهشي خبرگزاري دانشجويان ايران(ايسنا)، دانشگاه آزاد اسلامي واحد كرج به عنوان اولين واحد دانشگاه آزاد اسلامي موفق به جذب بودجه پژوهشي 12هزار دلاري از موسسه سوئدي International Foundation for Science شده است. اين بودجه توسط دكتر افشين رجبي خرمي، عضو هيات علمي گروه شيمي دانشكده علوم دانشگاه ازاد اسلامي واحد كرج جهت كار پژوهشي وي تحت عنوان «جداسازي و خالص سازي داروي ضد سرطان پاكليتاكسل از درخت تاكسوس باكاتا توسط فاز ساكن پليمر حك شده مولكولي» دريافت شده است.
پاكليتاكسل به دستهاي از تركيبات موسوم به تاكسانها تعلق دارد كه ديترپنهايي با ساختار تاكساني هستند. اثر پاكليتاكسل در درمان سرطانهاي تخمدان، پستان و ريه كاملا به اثبات رسيده است. 
اين ماده را ميتوان از گياهاني خاص استخراج كرد كه درختان از جنس تاكسوس مانند تاكسوس باكاتا از جمله متداولترين آنها هستند.
در اين پروژه با استفاده از يك ماده پليمري خاص از جنس پليمرهاي حك شده مولكولي و به كارگيري آن به عنوان فاز ساكن در كروماتوگرافي مايع، جداسازي و خالص سازي اين داروي ضد سرطان از درخت تاكسوس باكاتا كه داراي خاستگاه وسيعي در شمال كشور نيز ميباشد به انجام خواهد رسيد.
این وبلاگ برای علاقه مندان به رشتۀ بیوتکنولوژی توسط عده ای از دانشجویان این رشته ایجاد شده و امید است که با یاری دوستان و اساتید محترم بتوان اطلاعات مفیدی را در اختیار علاقه مندان قرار داد.