Biotechnology

قبل از اینکه بریم سر اصل مطلب جا داره اشاره ای به گل زیبای لی کنم که در دقیقه ۱۱۰ توپ را وارد دروازه استرالیا کرد و آبروی آسیا را خرید و اجازه نداد جام قاره کهن به سیدنی بره... وقتی جام به توکیو رسید خیلی خوشحال شدم احساس میکنم توکیو خیلی شبیه تهران خودمونه ولی شاید صد تا دویست سال پیشرفته تره..

........................................................................................................................................

با اینکه پیشرفتهای زیادی در زمینه زیست شناسی ژنوم و بیوانفورماتیک صورت گرفته است اما هنوز عملکرد بخش زیادی از پروتئین ها نا مشخص باقی مانده است. کشف عملکرد پروتئین ها از اینرو بسیار دشوار است که ممکن است یک پرونئین بیش از یک عملکرد داشته باشد. بنابراین برای کشف عملکرد یک پروتئین می توان از تعامل آن با یک پروتئین دیگر که عملکرد مشخصی دارد استفاده کرد. 

از اینرو تعاملات پروتئینی (PPls) حائز اهمیت است و این الگو می تواند در طرح ریزی برای ایجاد داروهای جدید موثر باشد.

بطور کلی سه نوع تعامل پروتئینی قابل پیش بینی وجود دارد:

1- تعاملات پروتئینی مستقیم

2- تعاملات پروتئینی مستقیم به همراه تعاملات پروتئینی غیر مستقیم

3- Pathway membership

شبکه تعاملات پروتئینی (PPls) را می توان با اصولی مثل پیش بینی تعاملی جفت پروتئینی (PW) و پیش بینی تعاملی بر اساس نمونه (BM) ایجاد کرد.

داده هایی که با استفاده از فنون آزمایشی با توان عملیاتی بالا در مقیاس بزرگ بدست می آید اغلب دارای خطای زیادی است حدود 40 تا 70 درصد که با استفاده از ویژگی های بیولوژیکی ناهمگن و روشهای محاسباتی میتوان کشف PPls را سرعت بخشید و دقت و صحت آنرا افزایش داد.